Lab-Rasool/honeybee-samples
HoneyBee Sample Files Sample data and resource files for the HoneyBee framework — a scalable, modular toolkit for multimodal AI in oncology. These files are used by the HoneyBee example notebooks (clinical, pathology, radiology) and by HoneyBee's molecular processing code at runtime (Hugo_symbols.tsv is fetched on first use of DNA mutation preprocessing). Paper: HoneyBee: A Scalable Modular Framework for Creating Multimodal Oncology Datasets with Foundational Embedding Models… See the full description on the dataset page: https://huggingface.co/datasets/Lab-Rasool/honeybee-samples.
1103
1%PDF-1.3
2%����3.0.1
36 0 obj
4<<
5/BitsPerComponent 1
6/ColorSpace /DeviceGray
7/DecodeParms <<
8/Columns 3400
9/K -1
10>>
11
12/Filter /CCITTFaxDecode
13/Height 4400
14/Length 7 0 R
15/Name /background_1
16/Subtype /Image
17/Type /XObject
18/Width 3400
19>>
20stream21�����������������W�N�~Z�28��)u�\C)�Pyܧe��#
:*�n�I�K$v�)��K;��ؚ��~�D��kC���HM��G&婜�}3�`���F!~W�-aq�� ���E㳼bp��;� �o� �$t�&���4��q�V��I�����w�O|=����/VU���*�h_�P���V��E����t� �Dr.�r��� ��^�������CF��VF����}�����+ ����@ЋBD22��@B��\�@�A i�4C��
���ld�C�娰l�(�D���O�-8o�h('a�Z.�*���3)-D[l�1�B>�0Fm�\��� E�O��e���K�Dq�5BB��Z���5���*���-�C 介�pd���EƂ23 va��N���;���k���А�^�oT��� �Nԑ�7�!�
?[�2@���3�@���R\��̏|`����&��/�W���M%��{ š�|"
D��%��t�����_��n��A���>��9jDpil�=��
�_���{C�Ҿ��6�������Ԡj8L�e��I$U����/�~��[ki�:��p��5Ƅ�.�� �H$�iQN���k�][����j�b��u�I%!�?����^�z���A̐G,p{`��w�a/���_k�����D4`-�t�$G���"p~�J�_k_���B�Â&@mL�G�����Z��$�$�һiw�ޫ�MP3�w氨^��� ��_�� [����i����_��������[H$�^���r�+
��C�������k��9�-�Ii$����e�XT�?]���o��]B�6+��Tl,��A��cu��_v�E����iC���->����������D���
�
����?NGv�����i8w+n��ӄ${V��BA�7�b��3�����A �6 �6E���A�\?�E�Y�0�mXah��Ze��x*�
�ob+ �tql4�wt��m+�24�S��a��wD4.~��wa���qP�a��@�W�1��WLn25��N�nO��Ͱ��A�E�,��vB��!=��{A��O�z
lS!bбp�9K�^�1526@θ\8��̓�!ZƁ�kP~vi7C���b�T���0C�"�����5�����a8`�*KH$� B�Pmq]C*�Ö��aC�Zy�H�-��z���i-��#����U�)�D]�;��]}�&Yd@!�1d4�+-"@��L�`�UAC =!#��0=5���r�I�A�"-S�*�a
,J�~bv��U�=�P�]�ZZ6+p��Բ� Gt~�[E;��B?�c�":x�i� ����S"DkG3�T.w��%ѴD#a�]���29F�l��tlS�3����XQD}N��9Ͳ����#�02Y�l�/�Dme����.�'���&\dtaق#��3a�G���!�Ȏ�|�#�TE2hQo����6ϑp�.27��.���ta�<��������#�"���B5����|DF�!�8�3�1˲s*�rɸ�"�űC�"$,E�qP""""""C]�IA����28QYM!R܃�<�":/���b"""$�"{eP) �٭�H�.G�o'29G����.��yf�f,#��=frPX�,��.�A! �Nx������f�T��d�30�Y^U�����)�_�&$�rq�P�@0q�0d&��2h�j�aK���Dp0_*Ѡs�62�G�%�'�"<]�F#H�3;��r���'"!�9319 DDDDDY�<H��DDIY�"�C<3A�!�ex*��A�����Hw(rND^�(Pe������GF_.��a��B<x4�#����_.DpY/���.l��x!�p3� �P�(r�0�q�l��e�:#DDE�9c�" �2!ܧ*320p�9;*@B��X��)�VA�t�D���DDDC7���A)����=DDDDDDDDA�gs�P�DE��98*e9Ze�m33�E����R�.�r�V�s�@PGv""!�C *��H34���P\BQ��b�+ap�V�R�"?V��Lt�����\[2��PG|�[Gv�g]�b�4��7�`�;{"�[N��&����}W-��a0����#�0��v�cD�k0�q%:�������ȰP���w��i�ʼn+]�]�
�W��r�O�k�;��������$i��r]���)ГXA�Ap�'=���'��ڠ�� aP{���3/�=}p����ЋA�ֽ��|a5¦��:35A�FG�I���hz l�Ui�گ'���7ȳs7�| �%�W�ګ� λj��}�N�z����#��-�a?#�r�!a��WlU��
^wk邧��� �蛼xC��5�Ar��k}܉��נ�_������:NU36=?��E!�8�*����������Wh0�I;mk�n����MzA,t��"6���$F�0���ȖD�\���I$����u���~�/�)�]xm&��tG�5�t��� � /�:��y'��_z���V�.��~�K-��o��/�'�n�!�!��������Cu �t����K���_ґ�W��&z����߾F����F��_����"�V�o �>��T��������}�u��Kv���5�N�_{��������!����h� �?I%{A��z��}X;c���ap����ff�n����:.��/�[��6��v���^=���U���o�b�⣴��
�I��������;����ك;5[H��[a���Z�xDV���C�N�W�4�@�ܘ�
>���ױ�U���'0���hD�P릚
? �
F� [����V�뭨�""""""-PPB�,1�`���D4�^�aw]~",��0�8ha��""�l=u���M�&������#PF���?�#
�ڤ(&�Z�D{ě"<ðHDD�d�A�����0|;�Ab"0B!�:�D��C(r�P��N!��� � ����37"?���������At\����pe�qx�͢;#�:7�%��2$G��;DPe�8\��Ѹ�#�����)�;��Dfd|�]́d<ֈ��s7E�3h�/EфG280\dpo����\3H4h����Fy1�,�
E����]�X�F��GF3q�ue�tGE���m�L��@B>4"D�z���+���a2��8F�l�3��)2˙����8)�a�˃p<6��]����P8dp.|�Q���Dp�pW""$��#x!q�<]��4�0!8G����A#!":#">]�a���'�h�0�ͳ�E��#��+�"�D�Ŕ9-#��9���9���ha���H�3�\�""AD�Ô��!��✡�r��p$U�L����r6�Q?��
i�q!��"""""",!e����ds.�h�B"!��
�A��8&c6�� �S��mF#3�菜Eѱ��G�""""#$9�r�3���9�A��PJ��#r �;�ag/��i�G�-����0�^�( �9�$9c�C�!�r�G��vC�,#�G�0�"""�����C��C/���GRfف38tf��tG�"""#q6""""""""""$�!vc.�<�.�)|����ʡ��aNPB
#��^a�h].9')ȓ�rH2r
���x'22�DC0�a��GrB"H�G�!D3��"""-�����������V""""����29��3��+�������g��L������!G�`�Z.��lˌ�e�P��ʰ���F!'B"'H��@�2�tg��3�2D.dvG39E�C8�#�`�����B˲:"2�
FȆ�)��l�G~���V�+�DDDDDC+S
���r�"""",��%""$~w5�G"�!��$dtyF�����|�����e�f$�DIЄA��,B��ENS��e9s��㖜H59nw���T�� �4s�w>9�T40��V�I̾n��F��39(*
�A��q��q�949PCXrn�ࠏ��������G�������������d���D���?� \��dtl2�3�F�DDDDDYN~<`�������-#$@Ѹ��G��˃<��c���U�HT2�@efȅ-%a��KJ�xnG��\ˁ�ŤCo@B"%"8��
�C<�L�TI41�Y���b��!ps<��H�D3 ��H���Q�5��a
�viL�7,��.%r�42��p\��FdfK���"�q�DC<!̏���kN����ג�!�L�4Ј�e�$�{
=����D'a����f�A�Dp̃&v
�@�����xG@�L�{�$nL�c\U�����]����A�;L ʝ2��3
������SP*ڄ����͠e����~�{���_�7,3@>��;~�n���0��" �mH(k������w���u��a�0$��������X�\H´��P#�^���o�߫�}S,�@ 1�'o3������t���^����/3����o`_��}���{u�A&��K��o��
kC�lkY�W�ޗ���`�{#���~���kǨD7������zش"n43�.~n����sE�M�����{@˸��`g��e�}�������$�]�߿�b��|�`ѫv�F�/�UW� �!�_��IT1��g�fdkSV�c�".�( �%�$�!�r���}V�f�����# ��Z�}_���DDHq�s�5P�0�@�m��B""$(�2��2��dS<r)�:�Ev��*|�Є҃5���Yv��fTY\XXj�B4B��j��5+5�t�"��),�#�S�X�D�s���BēT�DDDA����ȣ��*����)P��f�R`�Z�,�0�vQ�d�-�k` Be)��r1�s�Fx�ds�VAR@|�w;����d(0��D;p�����P�j�$hnx!ȩ��@��L�L̈�����2>F��@=0�qa�s�S��Z 0�F�b"" ���-�H��L
C!��Y���3F@@�t����v(�,�0Bld�a��d#Q+S� BA&���
�^�;~%\2 ���5 d.�D9�Y�!,�����\"��b�����:/�"�F�$�%����x�,��A!�� ��2n���0>z!d[PK-��`.q�Yn����� �yRZ:�q䤕�.$0\����d�9Yٞ��,C������1J7;"7�;8��D�dhN�"b5H�S%�$wPBad�,'�a�7�\"����p�h"[�F�B;;1�/a��ab�,��44(�l�BdC/MI��Ώ�P�XA�gs0C545GY7qtl6�Ac�lZ(�xh'�P�n�hC�!�k+2���A4��?��H,��#�#����a�Aa[�GU��M���tH s�����{ �w߿Z�����N�U{������������_U��+X^�t���A�?\X\��ij�z���?E"�>��7A�����K�_��6@��|��ۦ�v�vɞ��l7{�{c\>���K��~چ$��JI�u�a�v�/�!��W�A ��.4��K��*����ߠњ�۬O���*L?j��߬7�yŞ46p�]$��]?�q�h>�a$���j��^��V�`��}��v��ynq�}�e8����~�� ��Z ߅Uz�&q���[�sP�u ܜo�������X��Qo�M)w�}d\�5{U������ۯIG~��E�߿�V��ߴ�\�<i�A=֒g���>v�]��/��$A�M��}��;��}���{!$�֕�5�^��a�t��ZK��r�����w��\0�%��[c�zW�����j�����R��0�����VI�ڷ��5����^��#uJ�ND{�L=�=�h.P�|%���[��O~��;�
���|(C�.N�⮞�vףP�I��"R� � d��l*#��:!f���M�
o���>�ئ���X�@��Ȉ�6E���I�JȪ���47�@P�#a��M;
��!h���I�ƭ��M]1TJ�ED��9Qi�:)�N�+��I\h�BEjseT"4�����%����&�5�
�cX��� a��C�T,+�x�Tj�DD\�4�1^�Dmp�~7�U
�{߽] ��q�o�g}��z��.dM{�V�M_�����}�q\��ԯ�v�"�+�j�Ɵ2�PR8`�.@�4� Y]l�6e���B�m�+�D48����8܉gk9�A��y����8��G��\�d���R8�=�Ad��G�DF�C.!�Z���n�!�`�!
2@-�������7D#�0�p�.�]A�2pȀøD�d0$ҝ�3�! h��,C$�1��6�r>�KI, �nAlZ�D0NW)��(r��WIT9��rM^
�\���\Z^�����r�$9�q��0ԎQ!p�|�B�k��9���$�ZC�\0�A���!0�Pw.49�Y��ʙF���sbUT�ֽD��d�W�" �RIa�n��ˁ�B#�B`��?\�����$2C>�~�a�!�l�ߥ��0_o5��� f��͇L��o�d2Ar���dA���B����n�d2\s���J���Z��3F�[
�A���]�(M�T�l�}��
��&��e�#����F0�������� ��c�50�9����6�3h�]Ј�����`L������� ��<Pe��^�m�*Fl���"d
���/���2T��&�?�T���XBa��7�0q��r.���^��d�Vq�>�_�\�����W��wyj��+�ff ��+��8/��%����ﲜ}%A���Ȯ*?ޭ���ۤEC�O��Fa�O� �F��;>j����o�j�yk�б̖����?����wW ��DpW��xi�$CcSFƝ?�_��r]V�,n0C"