powellgenomicslab/scancestry-reference-data
scAncestry Reference Panel Reference data for scancestry, a tool for inferring genetic ancestry from single-cell genomics data. Reference genome build: GRCh38 / hg38. Contents This dataset bundles imputation, phasing, and population-reference files used by the scAncestry pipeline: gnomad.genomes.v3.1.2.hgdp_tgp.miss0.01.maf0.01.vcf.gz (+ .tbi) — gnomAD v3.1.2 HGDP+1000G common variants, used for PCA reference… See the full description on the dataset page: https://huggingface.co/datasets/powellgenomicslab/scancestry-reference-data.
059
1chr1,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr1.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr1.b38.gmap.gz2chr2,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr2.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr2.b38.gmap.gz3chr4,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr4.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr4.b38.gmap.gz4chr3,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr3.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr3.b38.gmap.gz5chr5,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr5.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr5.b38.gmap.gz6chr6,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr6.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr6.b38.gmap.gz7chr7,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr7.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr7.b38.gmap.gz8chr8,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr8.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr8.b38.gmap.gz9chr9,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr9.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr9.b38.gmap.gz10chr10,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr10.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr10.b38.gmap.gz11chr11,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr11.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr11.b38.gmap.gz12chr12,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr12.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr12.b38.gmap.gz13chr13,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr13.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr13.b38.gmap.gz14chr14,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr14.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr14.b38.gmap.gz15chr15,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr15.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr15.b38.gmap.gz16chr16,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr16.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr16.b38.gmap.gz17chr17,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr17.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr17.b38.gmap.gz18chr18,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr18.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr18.b38.gmap.gz19chr19,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr19.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr19.b38.gmap.gz20chr20,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr20.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr20.b38.gmap.gz21chr21,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr21.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr21.b38.gmap.gz22chr22,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chunks.chr22.txt,/path/to/ref_data/glimpse_chunks/chr22.b38.gmap.gz